Жители Кротона не собирались с этим мириться, они проявили агрессию и начали полномасштабное преследование пифагорейцев. Многие из странных сектантов были уничтожены, а остальные были вынуждены бежать. Выжившие попытались перегруппироваться и продолжить деятельность в другом месте. Однако они так и не добились такого же признания и власти, как в Кротоне, и секта вскоре прекратила своё существование. Что касается их странного лидера, то он был убит в ходе борьбы с его культом, и в различных источниках описывается его кончина.