В апреле 1970 года, во время войны во Вьетнаме, Флинн находился в командировке в Камбодже вместе с другим фотожурналистом, Даной Стоун. Судя по всему, эти двое были схвачены коммунистическими партизанами, но что произошло дальше, остаётся загадкой по сей день. Мать Флинна заплатила огромную сумму, чтобы найти его, но безуспешно. Больше никто не видел и не слышал этих двоих. В 1984 году Флинн по настоянию матери был объявлен умершим.
